“中国青少年科技创新奖励基金”标识中绿色部分是青少年的英文“YOUTH”的首写字母“Y”的变形，同时象征广大青少年在基金的支持下似破土而出的新芽，寓意祖国的未来——广大的青少年充满无限的潜力。蓝色部分是“中国”的英文单词“CHINA”的首写字母“C”的变形，重叠的“C”既代表着本基金是中国的青少年科技创新奖励基金，又象征着无限扩展着的科学的沃土。绿色象征着新生及希望，蓝色代表着广袤与力量，充分体现了邓小平同志对广大青少年的嘱托及希冀。